みけちゃんの状態は確かに飼い主さんとしては心配だと思います。
確定診断がなかなか付かなくて、猫ちゃんの状態はすこしずつ悪くなっているようですね？
確かに猫の疾病で診断の付きにくいものが多いことは事実ですから現在かかっている先生に問題があるのではないと思います。
現在の問題点としては腸管の運動性に問題がありそうなのでバリウム造影などを行ってみることは一つの手段かも知れませんね。

それと検査で否定されているようですが、骨髄に異常がありそうなこと（赤血球または白血球数の異常がみられている）と、免疫の異常を指摘されていることから
猫白血病ウイルス感染症はまだ可能性があると思います。
また、猫伝染性腹膜炎も考慮に入れる必要がありそうです。
通常の血液で調べる白血病ウイルスの抗原検査では陰性でも骨髄の潜伏感染などで骨髄の造血異常があることがあるからです。
かかりつけの先生と話をして、何が心配でいるのか、どこまでの検査を希望しているのかなどを相談されてはどうでしょうか？
年齢からは腎不全もありそうですし、、、（血液検査で簡単に診断が付きますからたぶん違うでしょう）
　あまりきちんとしたことが言えずにごめんなさい、もう一度僕ならばはじめから診断手順をみなおすと思います。