はじめまして。セキセイ飼いのケンケンと申します。獣医ではありませんが参考になれば幸いです。

　まずは４歳のセキセイちゃんですが。。。
　病院でもらったお薬は具体的にどんなものでしょうか？　抗生物質でしたら投与しはじめて３〜４日から効果が出てくると聞いています。
　居眠りですが、これは鳥の健康のバロメータと考えられるもので居眠りが長かったり、飼主の前で居眠りをするのは「調子が悪い状態」」といえます。
　糞便検査で悪いところが見つからない、とのことですが、それは寄生虫や真菌（カビ）、細菌が発見されなかったということで、もしかすると内臓そのものがなんらかの病気であるという可能性も考えられるのですが。。。。
　このまま同じ薬をのんでも効果がないようでしたら再診をお願いして、もう一度よく相談した方が良いでしょう。

　３歳のセキセイちゃん。。。
　仲が良いのはとてもすばらしいことなのですが、やはり病気のセキセイと一緒にするのは病気のコの方にかなりの負担がかかります。飼主さんが一日中付きっきりになれる日に別居させてじっくり様子をみてください。暴れるようでしたら声をかけて気を紛らわせてあげて下さい。
　鳥は「病気を隠す」という習性があります。ペアの相手、同居の鳥、飼主でも病気ある、というのを悟られるのは病鳥にとってとてもストレスになります。

　下記ホームページにてセキセイインコに関する情報集を載せていますのでよろしかったらのぞきに来て下さい。
http://www2.justnet.ne.jp/~maki/WELCOME.HTM