参考に〜ではなく、こんな人もいるくらいに読んでいただけたらと思います。
先住猫のことですが、2年も独り占めしていたところへ新入りが犬ではなく猫だったら？少なからずショックをうけるのは当然ではないでしょうか。その場合はトイレを別々に離れたところに置くということができます。でも猫ではなく犬。ショックは大きいと思います。
柴犬はお座敷犬ではありませんのでそんなに簡単にトイレができるとは思えません。犬をケージに入れて、トイレがちゃんとできるまでは出さないほうがいいと私は思います。
わざとらしいくらい、先住者は優先すべきです。今まで独占してきた２階のそこらじゅうに犬の尿の匂いがつけば、猫だって嫌がります。
時間が解決の以前に、犬を出すのはハウストレーニング・トイレトレーニングを完璧にして、猫が戻ってこられる環境にしてあげればよいのではと思います。
もしスペースがあるならこの部屋は犬が自由にできるとか、広めのサークルでそれ以上は出られないようにするとか、とにかく猫の居場所を作ってあげてください。
毎回トイレに失敗とありますが、今はまだ自由に部屋を歩ける時期ではないと思います。私は犬も猫も小動物も大好きで外にはあひるまでいたりします。人の勝手で異種の動物を一緒に生活させるのですから、その動物の習性は少しでも大事にしてあげるべきだと考えます。いつのまにか２頭でお昼寝！を目指して、ゆったりがんばってくださいね。