＞引き取った時には既にフィラリアに感染していたので、今は毎月フィラリアの薬を飲み続けています。

これは、獣医師の診察を受けて、フィラリア予防薬服用後のショックが出てこないように
処置しながら服用しているという理解でよろしいのですよね。
フィラリア感染犬への予防薬の投薬は危険を伴いますので、そのまま服用させることはできません。感染が確認できているということと、薬が出ているという点からは、獣医師が対応しているであろうとは思いますが、とても重要な事なので敢えて言及させていただきます。

＞その犬が、最近夜の散歩に行きたがらなくなりました。
朝の散歩は行くのですが、３.４日前から夜だけ行きたがらなくなりました。
いつも散歩は朝と夕方の１日２回で、１時間以上は必ず行っていました。
最近は暑かったので夜８時位に涼しくなってから行っていました。

肝心の夜の散歩に行きたがらないという方ですが、とりあえず２点ほど思いつくことがあります。
１つは、その時間帯にサインポストで警戒したくなるような臭いがするのではないかという点です。まあ、これは嫌な音がするでもよいのですが、何かしら人間に分からないところで犬にだけ感じ取る事ができる忌避すべき理由があるのではないかという意味です。

もう一つは、視力に支障が生じているのではないかという点です。こちらは、わりと経験があります。街灯がない暗い夜道を嫌がるようになるというのは、よくあるように感じています。小型犬ですと人間を当てにしているのか、あまりそのような事がないのですが、大きめの犬で自分が人間よりも先にたって歩きたがる犬の場合は、暗いところを避けるようになるようです。

最初の方の原因究明となりますと、いささか面倒ですが、後者のケースですと、動物病院に相談してみるとよいかと思います。