獣医師ではありません。猫との生活が長いものです。
ＦＩＰの交替検査値が４００と言うことですが、現在発病しているのでしょうか？
とても誤解が多いですが、ＦＩＰの交替検査、と言う名前で呼ばれていても、これでわかる値はＦＩＰかも知れないし、コロナウイルスかも知れません。この辺の説明は獣医さんから受けられましたか？もしまだのようならもう一度詳しい説明を受けられることをお奨めします。
コロナウイルスというものは、ほとんどの猫が持っている、単純な下痢を引き起こすそんなに怖いウイルスではありません。
しかし、そのコロナウイルスが何かの突然変異、または猫のストレス、または何らかのアレルギーによって、ＦＩＰウイルスに変化してしまって、はじめてＦＩＰと言う病気が発症します。ですから、抗体価が４００で陽性、と出てもＦＩＰにかかっているとは断定できないのです。
もし発症してしまっているとしたら、現在では延命治療しかありません。１歳未満に危ない時期があって、現在２歳という事はＦＩＰの発症とは違うように思えますが・・・。（この辺は専門家ではないので、想像ですいません）

なお、発情のストレスと避妊手術のストレス、どちらが大きいか？というと私自身の経験ですが、発情が繰り返されるストレスの方が大きいと思います。

ＦＩＰについての詳しい説明は下記のページにあります。ご参考になさってください。
http://www.jbvp-forum.com/