副作用を懸念して受けない方もいらっしゃるようですが、それによって発病してしまったことを考えると、受けておくべきではないかと思っています。
残念ながら日本ではフェレット専用のものが認可されていませんので犬用を使うことになるわけですが、副作用やアレツギーは人間と同様に発生率は低いものの、そういうことがあると認識しておくことになります。
よく使用されているのはドヒバック・京都微研になりますが、それでも100％安全というわけではありません。
私の知っている限りですが、一回目の接種後三週間開けて二回目を接種したと思うんですが、二週間だと少し間隔が短いですね。
アレルギーも詳細が分からないですけど、痙攣や発熱、嘔吐といった場合には、応急処置が必要になります。
普通のアレルギーは抗アレルギー剤の投与で快復しますが、この場合はワクチン効果がなくなるので、対処治療されることもあるようです。

最初にも書きましたが、予防接種を受けないという選択肢もあるのですが、この場合にはフェレットも飼い主さんもペットショップや病院、動物関係のイベント（接すること）は慎むべきことになります。
副作用や接種による発病の危険性はありますが、家族でもあるフェレちゃんをどう守るかよく検討してみてください。
アレルギー反応を起こしたフェレちゃんには、二度とワクチン接種が出来ないのかどうかは分かりませんでしたので、仲間に同じような経験をされた方がいないか聞いてみますね。