夜に吠えるのは、地震のときの恐怖感が残っていたり、それが原因の不安があるせいだと思います。震災前と今とではなんとなく違う気配をわんちゃんは感じているのかもしれませんね。
犬は聞き慣れない音に過敏に反応しますから、上空をヘリが飛んだり、車がたくさん通るようになったり、近所で工事の音が続いたりするとそれだけでものすごく不安です。
また、遠くで吠えている犬がいて連鎖反応で吠えてしまうこともありますしね。
吠え続けるとノドが乾く、ノドが乾くから水をたくさん飲む、水をたくさん飲むからおしっこが我慢できなくなる、そういう理由で車庫の隅におしっこをしてしまうのだと思います。
吠えることも車庫でおしっこをしてしまうことも、もうしばらくの間は目をつむって許してあげてください。
夜中に吠えてもできれば顔を見せないほうがいいと思います。呼べば来てくれると思うようになってしまうとこの先ずっと吠え続ける犬になってしまいますから。
不安だったけどひとりで車庫にいた、鳴いてみたけれど誰も来てくれなかった、仕方ないから吠えるのをやめてベッドで寝た、そういう繰り返しをして犬自身が「もう大丈夫なんだ」と理解していくしかないと思います。
ベッドで寝るようになったということは、落ち着きを取り戻しつつあるということだと思います。もう少し時間がかかるかもしれませんが、わんちゃん自身が自分で不安を解消していくのを見守ってあげてください。