何か、犬のしつけの本などは読んで見られたでしょうか。
トイレのしつけは、成犬だろうと、子犬だろうと方法は同じなのです。
トイレのタイミングにトイレまで誘導し、そこでしたら褒めちぎる、これに凝縮されます。

しかし、排泄をあちこちにされるというストレスは理解できます。できますが、私はまず今は人側の気持ちよりも
犬の気持ちになって考えていただきたいと思っています。

＞凄く臆病で自己主張がなく、尻尾がいつも足の間に挟まってます
これは、おっしゃるとおり、犬は一番感受性の強い時期に、人に話しかけても笑いかけてももらえなかったので、「人とは餌をくれるもの」としか理解していないと思われます。
感情がないのです。痛いことをしても、怒りませんし、鳴くこともないはずです。
つまり、病気をみつけるのも困ることになります。
ならば、今すべきことは、人とは、安心、安全な寝床とたっぷりの食事を用意してくれる存在であると思わせることだと思います。

犬のしつけ本にもあるように、大き目（畳一畳ぶんくらい）のサークルの中に、バリケンなどを用意し、そこにタオルなどをひいて
寝床を用意します。そしてバリケンの横にトイレを設置していつでも排泄ができるようにしてあげてください。
また、排泄をしているのが分かった時は、やさしく声をかけてあげましょう。
いいんだよー。ここで排泄してもいいんだよーって。決してしかってはいけません。

そして今は、極力サークル内で生活をさせていきましょう。サークルの中から人の会話を聞いたり、どういう場所か
観察しているはずです。
無理にサークル内から出したり、抱いたりするのは不安を植え付けてしまいかねません。
「この人は絶対に自分を守ってくれる、ここは安全な場所だ」と思えば自然と自分から
サークルから出てくるようになるでしょう。
もちろん、サークルのドアを開けておいて、何かあったときはすぐにバリケンに身を隠せるように留意してみてはいかがでしょうか。

スワレやマテのコマンドは食事の度に教えればできるようになるはずです。
でも、焦ってはいけませんよ。
できれば極力笑顔で対応してあげてください。
そして象の歩みのようにちょっとずつ、人と距離が縮んでくるでしょう。

しつけも大事ですが、「信頼される」事の方が、今は重きを置いて欲しいことです。
信頼関係が生まれれば、自然と犬はリーダーの指示に従うのです。

１年後くらいかな、気づいた時には、普通に鳴いたり、笑ったりする犬になっていますよ。
がんばってください。