確認ですが、現在飼われている猫は、保護したメス猫、元々居たオス猫、この２匹の子供の猫３匹でよろしいでしょうか。
そして、この親ネコ２匹が伝染性腹膜炎と診断を受けているのですね。

この診断は、血液検査にて、コロナウィルスの抗体価を測っているに過ぎず、現在伝染性腹膜炎の特徴的な症状を表していなければ
将来、この病気を発症する恐れがあるかもしれないということにしかなりません。
つまりどういうことかというと、ちょっと難しいのですが、猫伝染性腹膜炎はコロナウィルスによって引き起こされる致死的な病気ではあるのですが
それは、体内の今は「無害の」コロナウィルスが突然変異をすることでこの病気になるのです。

この突然変異がなぜ、起こるのかは免疫不全によるものであろうとされています。
つまり、他の免疫不全を引き起こす猫エイズや猫白血病ウィルスなどに感染したり、あるいは劣悪な環境、スペースに合わない(猫がストレスを感じる）
多頭飼育などが要因であろうと説明されています。
猫から猫に直接うつる事はなく、便中のコロナウィルスが問題のようです。

子供の猫も検査をしておくほうが良いのではあるのですが、感染機会は糞便ですので、なるべく複数のトイレを用意し（理想は猫の数プラス１とされています）
便は直ぐに片付けること、塩素系漂白剤の薄めたものでの消毒でも十分効果はあるようですから
トイレを洗う時はこれらの消毒をすることなどをなさればよろしいのではないでしょうか。

猫さんが快適に暮らし、清潔を保つことが大切なようです。