ゆみさん、うんちの具合、あんまり良くないんですね。
以前書いたように、抗生剤のせいで、腸内の有効な細菌まで減ってしまって、
それがうんちの状態を悪くすることはあるようです。

うちの子は、乳酸菌のタブレット（大好きんやアリメペットという名前で売られてます）や
小匙１杯程度のヨーグルトを投薬時にあげていたので、
お腹の調子や毛艶など、結構いい感じで乗り越えることができました。

獣医さんによっては、ヨーグルトなどの牛さんのお乳から作ったものはダメって
考えの方もいらっしゃいますし、ビオフェルミンなどの人間用の乳酸菌の製剤を
少量与えるようにと指示する方もいらっしゃいます。
うさちゃんのお腹の調子をみながら、こういったものを試してみられてはいかがでしょう？
「減った分を補う」という意味で、有効だと考えます。

あと、パスツレラ菌に関しては、ほとんどの場合が、症状と抗生物質の効果の現れ方などで
「パスツレラ菌によるスナッフル症状」などと診断される場合が多いようです。
ただ、検査してくれる病院もありますよ。
ある程度の期間と、お金と、あとは鼻水など検査に必要なものが採れるか．．．など
ありますが、幾つかの病院に「パスツレラ菌の検査は出来ますか？」と電話で聞かれても
よいかと思います。
検査をお願いするなら、大学病院などをあたってみるのも良いかと思いますよ。

ただ、パスツレラ菌自体は、ほとんどのうさぎが持っている菌ですから、
鼻水などが沢山出てないと、検査は難しいかな？って気がします。
（素人ゆえ、詳しくわかりませんが）

背中のフケのようなものに関しては、皮膚病の可能性もあると思います。
獣医さんで検査してもらったら安心ですね。
簡単な顕微鏡を覗いたりって検査で済むはずですし。

暴れているのは、ひどく痒くて．．．ってことはありそうですか？
今は、闘病中という、ストレスのかかっている時期だけに、
気持ちがクサクサしてるのかな？
もし、すごく痒くて暴れてるんだとしたら可哀想だし、一度、診てもらったら安心かと思います。
早く治るといいですね。