レスが遅くなってしまってごめんなさい！
私は神奈川の病院のことは分からないのですが、モモンガオーナーが多数
ご覧になるメーリングリストでお尋ねになるのが一番といいと思いますよ！
モモンガリンク集の「ももんがーず わーるど」で、メーリングリストの
登録が出来ます。
神奈川在住のモモンガオーナーさんからきっとレスがもらえると思います。

> 輸送のストレスとかも考えると、便だけで検便していただける
> 所がいいのではないかと考えてます。

便だけの検査ならほとんどの動物病院でしてくれると思いますよ。
でも、いざというときモモンガを診てもらえる病院をみつけて、
かかりつけの病院にしたほうがいいと思います。
便だけを持っていく場合も、個体の名前と年齢と体重をメモして持って
行くといいです。病気の早期発見にも役立ちます。

便を持っていくときには、できるだけ新鮮（笑）なものを、
乾かないようにラップにくるんだりして持っていってください。
採取から診察まで時間が開く場合には冷蔵庫での保管をオススメします。
（ちょっと抵抗があるかもしれませんが・・・）

それでは、ぜひぜひ早めに検便にいってくださいね！