種類や温度にもよりますが、小さなハエのライフサイクルは数日だったりします。
　つまり月イチ交換は交換の意味をなさないということになります。
　
　ハエが発生するのに必要な条件から考えてみるとよいかと。
　幼虫の生育には湿ったエサ、蛹化には乾いた場所が必要です。とはいうものの、蛹化できないほど湿らせるとカメにまずいのはもちろん、嫌気性発酵でにおいがひどくなりますから、結局は乾かすしかありません。
　床材は、もたらされる水分が少ない限り、局所的に湿った糞の水分を薄めてくれますが、空中の湿気が多くなれば、かえって糞を乾きにくくしてしまいます。
　かといって数日ごとに全取っ替えも現実的ではないでしょうから、床材をなくしてしまうのが早いかと。面積とカメの排尿量が釣り合わないのでしたら、ベットシーツ＋カバー金網程度の最低限の床材にするとか。特段の必要性がない限り、床材ぱないほうがいいのです。

　ガラスのように滑りやすい場合はその対策がいりますが、床材でなんとかするよりは滑り止めがおすすめです。

　なお、殺虫剤の類も使えなくはありませんが、何に対して有毒であり何に対しては有毒でないか、その理由は何か、というあたりまで調べて理解しないといささか危険です。まずは乾燥させること、そのために余分な「水分保持体」を撤去することから始めれてはいかがでしょうか。