になももさん、やわらかうんちの原因は、ペレット食べ過ぎなのかも？
うちのうさぎがペレット食べ放題にしていた時も、そういうことがありました。
不正交合でしかも牧草を食べてくれない子（うちにも２羽います〜）のメニューには悩まされますが、
水の飲み過ぎとか野菜の食べすぎだから下痢をする、とは一概に言えないように思います。
（野菜が洗ったままで水浸しとかの場合は別として）
うさぎはもともと 高繊維・低蛋白質の食事を心がけるべし、と言われていて、蛋白質や炭水化物、糖質の多い食事は うさぎのお腹によくないのです。
許容量以上の栄養をうまく分解できず、腸内の悪玉細菌が優勢になって、下痢したりお腹にガすが溜まったりするらしいです。
ペレットはもともと食肉用や毛皮用や実験用のうさぎのために作られたものなので、高カロリー高栄養、蛋白質や糖質も多く含まれています。
自然界ではちょっと出会えないゼイタクなメニューと言えるので、食べ放題はうさぎの体によくないと思われます。
お腹を壊したり、繊維質で歯が削れなくて伸び過ぎたり、内臓疾患が発生したり、といろいろ問題を引き起こすことが最近分かってきたらしいです。
それらのことから、ペレットは栄養補助食品と考えて、幾らか制限した方がいいのではないでしょうか。
あと、うさぎのおやつやパン、果物なども あげすぎると下痢してしまいます。

本当は牧草（繊維質豊富）を食べてくれればいいのですが、不正交合などで食べられない子の場合は かわりに野菜をたくさんあげたりする方法がありますよ。
色んな種類のものを毎日バラエティ豊かにあげるのが理想的ですが、1日3種類以上とか。
うさぎはもともと粗食の動物でもあるし、野菜や牧草を十分あげていればペレットをかなり制限しても栄養失調にはならないのではないかと 私は思っています。
ちなみに、うちの健康うさぎ3羽は牧草食べ放題、その時々にある野菜 が基本メニューで、ペレットは1日平均5粒以下しかあげていませんが、ここ1年そんな食生活で元気すぎるくらいです。
（一日5粒以下、というのは歯専門の先生の説に倣ってみたもの）

ももちゃんの場合は、取り敢えずペレットの量を少し減らしてみてはいかがでしょう？
許容量はそれぞれ違うと思うので、その後も加減しながら適正な量をみつけるとか。
ぴたりと下痢が止まったりしますよ。